１０００年の時を超える長編小説「源氏物語」を生み出した女流作家・紫式部の波乱の一代記。平安中期、京に生を受けた少女まひろ（落井実結子）、のちの紫式部。父・藤原為時（岸谷五朗）の政治的な立場は低く、母・ちやは（国仲涼子）とつつましい暮らしをしている。ある日まひろは、三郎（木村皐誠）という少年と出会い、互いに素性を隠しながらも打ち解けあう。再び会う約束を交わす二人だったが…激動の運命が始まる。

母の死から６年、まひろ（吉高由里子）は１５歳となり成人の儀式を迎える。死因を隠した父・為時（岸谷五朗）との関係は冷めきる中、まひろは代筆仕事に生きがいを感じている。一方、道長（柄本佑）は官職を得て宮仕え。姉・詮子（吉田羊）が帝との間に皇子をもうけ、道長の一家は権力を拡大していた。道長の父・兼家（段田安則）はその権力をさらに強固なものにしようと道兼（玉置玲央）を動かし天皇が退位するよう陰謀を計る。

自分のせいで放免に捕らえられた道長（柄本佑）を心配するまひろ（吉高由里子）。しかし、父の為時（岸谷五朗）に謹慎を強いられたため、ただ案じることしかできない。兼家（段田安則）の指示で道兼（玉置玲央）は女官を使って帝の食事に毒を仕込み、円融天皇（坂東巳之助）は急激に体が弱っていく。政権を掌握するために二の手を打ちたい兼家は、ライバルの左大臣家の動向を探るため、為時を利用してまひろを間者として送り込む。

互いに身分を偽ってきたまひろ（吉高由里子）と道長（柄本佑）だったが、まひろはついに素性を明かす。道長も真実を語ろうとするが…その頃、円融天皇（坂東巳之助）の譲位を知った詮子（吉田羊）は挨拶のために謁見するが、思いもよらぬ嫌疑をかけられる。ある日、まひろは倫子（黒木華）からの依頼で、即位した花山天皇（本郷奏多）の前で五節の舞を披露する舞姫に選ばれる。そこでまひろは驚愕（がく）の真実を知ることに…。

まひろ（吉高由里子）は道長（柄本佑）と距離を取るため、そのライバルの左大臣家で間者を続けることを決断。一方、道長は道兼（玉置玲央）の口から、まひろの母の事件をもみ消したのが兼家（段田安則）であることを知り、一家が背負う闇の深さに戦りつを受ける。そんな中、宮中で勢いを増す義懐（高橋光臣）一派に対抗するため、道隆（井浦新）は若い貴族たちを招いて漢詩の会を催すことに。参加を申し出たまひろだったが…。

道長（柄本佑）への想いを断ち切れないまひろ（吉高由里子）は、没頭できる何かを模索し始める。散楽の台本を作ろうと思い立ち、直秀（毎熊克哉）に直談判。まひろの演目は辻で披露され、次第に評判を呼び大盛況に。噂を聞きつけた藤原家の武者たちが辻に駆けつけ大騒動に。一方、道長や公任（町田啓太）ら若者たちはポロに似た球技・打きゅうに参加する。招待されたまひろは倫子（黒木華）たちと見物に行くことになるが…。